Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms