Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHX8Q68G74 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms