Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRAGBQ5VZM2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms