Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECM29Q5VYK3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms