Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAMD13Q5VXD3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms