Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRNL1Q5VV63 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRNL1Q5VV63 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms