Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH2Q5VUJ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms