Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf135Q5VTT2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms