Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms