Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOGA3Q5TF21 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms