Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP2LQ5T4T6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms