Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIVEP3Q5T1R4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIVEP3Q5T1R4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms