Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FRMPD1Q5SYB0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms