Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C10orf55Q5SWW7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C10orf55Q5SWW7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 349.8 ms