Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PERM1Q5SV97 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PERM1Q5SV97 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms