Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms