Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ANKRD39Q53RE8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms