Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF394Q53GI3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF394Q53GI3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms