Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC44A4Q53GD3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC44A4Q53GD3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC44A4Q53GD3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC44A4Q53GD3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC44A4Q53GD3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms