Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLHL12Q53G59 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms