Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C4orf17Q53FE4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C4orf17Q53FE4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms