Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC1Q4ZHG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC1Q4ZHG4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms