Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms