Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRFIP1Q32MZ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRFIP1Q32MZ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms