Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL38Q2WGJ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL38Q2WGJ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms