Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB5Q2M3G0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB5Q2M3G0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms