Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SKIDA1Q1XH10 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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