Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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