Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LAMA3Q16787 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAMA3Q16787 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms