Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTF1Q16619 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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CTF1Q16619 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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CTF1Q16619 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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CTF1Q16619 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTF1Q16619 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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