Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASIC2Q16515 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASIC2Q16515 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms