Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA4Q16363 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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