Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD2Q16342 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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