Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC6Q16204 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC6Q16204 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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