Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK4Q16099 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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