Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGN3Q15651 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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