Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRADDQ15628 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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