Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA2Q15560 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA2Q15560 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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