Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIV2LQ15477 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIV2LQ15477 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms