Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
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