Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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RAB35Q15286 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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RAB35Q15286 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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RAB35Q15286 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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RAB35Q15286 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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RAB35Q15286 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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RAB35Q15286 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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