Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PCM1Q15154 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PCM1Q15154 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCM1Q15154 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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