Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRS1Q15050 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRS1Q15050 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms