Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1I3Q14994 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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