Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFIXQ14938 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFIXQ14938 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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