Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IHHQ14623 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IHHQ14623 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IHHQ14623 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IHHQ14623 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IHHQ14623 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IHHQ14623 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IHHQ14623 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IHHQ14623 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IHHQ14623 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IHHQ14623 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms