Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERV3-1Q14264 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms