Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM53BQ14153 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM53BQ14153 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms