Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPSQ13938 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPSQ13938 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms