Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C1DQ13901 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1DQ13901 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1DQ13901 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1DQ13901 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1DQ13901 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1DQ13901 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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